目前有药用记录的藏药达2294种。常用300多种，其中植物类200余种；动物类40余种；矿物类40余种。常用藏药中有三分之一用药与中药相同，藏区本地草药占常用藏药一半以上。
1．藏药的使用与藏医的理论体系紧密结合。
由于藏医诊断最终归结为“寒症”、“热症”两大类型，故藏药方剂亦按其性质将药区分为“热性”、“寒性”两大性能。藏医在治疗“寒症”时用“热性”药，治疗“热症”时用“寒性”药。
2．藏药按八性、六味、十七效来分细类。
八性将藏药分为轻、重、润、糙、锐、钝、凉、热八种性质；六味将藏药分为甘、酸、苦、辛、咸、涩六种味道。他们认为，甘可滋补，酸助消化，苦可降火利胆，辛能除湿去寒流，咸能温胃去虚，涩可调合诸味；十七效将藏药归纳出柔、重、温、润、稳、寒、钝、凉、软、稀、干、干枯、热、轻、锐、糙、动等十七种效能。
3．藏药治病多采用数药合成，很少使有单方。
许多药方配药都在25种以上，有的甚至高达七八十种、100多种。如“然纳桑培”（译成汉语即“珍珠七十”）配方多达70味。
4．藏药在使用上大都有副品或代替品。
为了解决珍贵药源不足的问题，藏药除本名正药外，特规定了与此药性质、类别相同、相近的副品或代用品。正品用“却”注明，代替品用“慢恩巴”注明。
5．藏医非常重视藏药的加工与炮制。
藏药主要炮制的方法有三种：火制法、水制法和水火合制法。藏医治病的剂型主要有散剂、水丸剂和汤剂、膏剂、脂剂五种。他们把制好的药物按病人症状分别配制成散剂、丸剂、膏剂、脂剂，让病人服用，非常方便。